Crean una herramienta de Big Data para estudiar el ADN de bacterias

Investigadores de la Universidad de La Laguna y del Hospital Universitario Ntra. Sra. de Candelaria, adscrito a la consejería de Sanidad del Gobierno de Canarias, en colaboración con el Instituto Tecnológico de Energías Renovables (ITER) de Tenerife, han desarrollado una web de acceso público que permite, entre otras cosas, ensamblar rápidamente genomas bacterianos. Este proyecto colaborativo, denominado IonGAP, es posible gracias al uso del superodenador Teide-HPC (High Performance Computing), ubicado en el ITER y considerado en la actualidad el segundo más potente de España. 

IonGAP es una herramienta web de gran utilidad para estudios enmarcados en contextos clínicos y biomédicos, así como de aplicación para el área farmacéutica. Su alta capacidad de procesado permite reducir el tiempo y el coste de los trabajos de investigación que requieran el análisis exhaustivo de datos vinculados con el ADN de las bacterias.

Esta iniciativa nace del proyecto de fin de carrera del estudiante Adrián Báez (Ingeniería Informática) y de la necesidad de los investigadores involucrados en crear una herramienta integradora para el análisis de datos de secuenciación masiva de ADN.

Su puesta en marcha se realizó el 28 de noviembre de 2014, ofreciendo acceso gratuito a través del portal web http://iongap.hpc.iter.es. Hasta hoy, la herramienta IonGAP ha sido utilizada por investigadores nacionales e internacionales en 47 proyectos distintos de países como México, EEUU, Chile, Australia, India, Alemania, Inglaterra o España. 

Se espera que la creación de esta web facilite la secuenciación de ADN de bajo coste y el posterior análisis de los genomas bacterianos para la prevención y control microbiológico, así como en aplicaciones de la industria farmacéutica y agroalimentaria.

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Fuente: Prensa ULL